Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPAA1O43292 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPAA1O43292 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms