Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C2AO00443 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms