Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC69A6NI79 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC69A6NI79 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms