Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1C4

TRBV27, T-cell receptor beta variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV27A0A0K0K1C4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV27A0A0K0K1C4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms