Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms