Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA3Q9Y6Q9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms