Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA3Q9Y6H8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA3Q9Y6H8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms