Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC11AQ9Y240 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC11AQ9Y240 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms