Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC3Q9UQE7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms