Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZRN3Q9UPQ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN3Q9UPQ7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms