Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTF2Q9UNY4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms