Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms