Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms