Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms