Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIMD1Q9UGP4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms