Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5BQ9UGL1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms