Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LPAR3Q9UBY5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms