Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXTL2Q9UBQ6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL2Q9UBQ6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms