Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2S2

NRXN2, Neurexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN2Q9P2S2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NRXN2Q9P2S2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRXN2Q9P2S2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms