Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
REREQ9P2R6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
REREQ9P2R6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms