Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms