Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms