Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf78Q9NZ63 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms