Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBRD1Q9NUN5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms