Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms