Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms