Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms