Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFGAP3Q9NP61 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms