Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL513123.1-201ENST00000415883 597 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms