Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NYXQ9GZU5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms