Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4AQ9BY43 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4AQ9BY43 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms