Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms