Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD5Q99666 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms