Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRAMP1Q96RY5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms