Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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