Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms