Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms