Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms