Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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