Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGMS2Q8NHU3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms