Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELBQ8NG08 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms