Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L2Q8NAA4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms