Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTLL6Q8N841 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL6Q8N841 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms