Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC24Q8N4L8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms