Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML1Q86YW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms