Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RAB11FIP4Q86YS3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RAB11FIP4Q86YS3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RAB11FIP4Q86YS3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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