Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms