Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC29A4Q7RTT9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms