Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCBE1Q6UXH8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms