Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms